协议离婚和起诉离婚是两种不同的离婚方式，一般不会冲突。协议离婚是夫妻自愿达成离婚协议，可以在婚姻登记机关或法院进行登记或审核，无需经过法院的审判程序；而起诉离婚是通过向法院提起诉讼，经过法院审判后达成离婚协议。虽然两种方式在离婚协议的达成上有所不同，但都可以从法律上解除夫妻关系，属于两种合法的离婚方式。
但是，如果在协议离婚过程中，夫妻双方达成不了一致意见，那么离婚协议就无法达成，此时，任何一方都可以向法院提起离婚诉讼，要求法院做出判决。此时，协议离婚和起诉离婚就会发生冲突，因为合法的离婚必须得到法院的审理和裁决。
除此之外，协议离婚和起诉离婚也可能在分割财产、抚养子女、赡养老年人等方面发生分歧。在协议离婚中，夫妻双方应根据法律规定自主达成财产分割、子女抚养、老年人赡养等协议，并经过登记机关或法院审核生效。而起诉离婚则需要由法院审判判决，这可能导致夫妻双方对分割财产和抚养子女等问题上存在争议，需要法院依法加以解决。
总之，协议离婚和起诉离婚并不是有冲突的关系，只要夫妻双方能够自愿达成协议，即便是通过起诉离婚达成协议，仍然可以实现离婚。但是，如果在协议离婚过程中出现争议，起诉离婚可能会成为解决问题的途径。在任何情况下，夫妻双方都应该尽力协商解决问题，减少离婚过程中的矛盾和冲突。
