根据中国《婚姻法》的规定，夫妻双方因感情不和等原因需要进行离婚时，如果有子女，则应当由夫妻双方协商确定子女的抚养、教育和往来问题。如果双方无法协商，则可以向法院提起诉讼，由法院根据实际情况进行判决。
在协议离婚中，夫妻双方可以自主协商子女的抚养问题。一般情况下，离婚后，子女的抚养权归一方，另一方支付抚养费。子女的抚养权可以分给一方或者共同抚养，具体取决于双方协商的结果。
协议离婚中，子女的抚养问题是需要重点考虑的，因为如果没有妥善解决，会直接影响到子女的成长和发展。双方应该以子女的利益为出发点，尽量减少对子女的伤害。如果双方能够协商一致，并以书面形式确定了子女的抚养事宜，这份协议在法律上具有约束力，双方应该认真履行协议中的义务。
总之，在协议离婚中，子女依然有抚养权，但具体的抚养问题需要夫妻双方通过协商或者诉讼解决。双方应该认真考虑子女的利益，妥善处理子女的抚养问题。
