协议离婚可以变更子女抚养权，但需要经过双方协商和法院的确认。
在协议离婚过程中，双方可以商议变更子女抚养权的事宜，例如子女的监护人、居住的地点、教育方式等。若达成协议，需要将变更的事项确定清楚，并在离婚协议书中注明。
而在法律程序中，变更子女抚养权需要通过法院的确认。在提交离婚申请时，可以在诉讼状中提出申请变更子女抚养权。法院将根据双方的请求和实际情况，作出最终判决，确定新的子女抚养权归属。
需要注意的是，子女抚养权变更需要充分考虑子女的福利和权益，切忌将子女作为争执的对象。此外，若变更后的抚养人发现无法承担子女的抚养责任，或变更后的另一方存在虐待或疏于抚养的情况，可以向法院申请变更抚养人及子女居住地点。
