协议拆迁是指房屋所有者和拆迁管理机构或拆迁补偿委员会在自愿基础上达成的拆迁协议。在协议拆迁中，房屋所有者可以更自主地参与拆迁协商，更灵活地选择拆迁方案，更加合理地确定拆迁补偿方案，因此在很多城市受到了房屋所有者的欢迎。
然而，尽管协议拆迁可以让房屋所有者在拆迁中更有发言权，但在政府需要通盘考虑城市发展、社会公益等因素的情况下，政府仍然可以根据相关法律法规，对协议拆迁的房子进行征收。具体来说，主要有以下两种情况：
一、 拆迁标准和征收标准不同：在协议拆迁中，由于房屋所有者和拆迁机构之间的谈判会影响到拆迁标准的确定，因此协议拆迁的标准和征收的标准有时会存在不一致的情况。例如，某城市的协议拆迁标准是每平方米5万元，而该城市的市长指示，征收标准应该是每平方米3万元。这种情况下，政府可以根据征收标准对协议拆迁的房子进行征收。
二、 拆迁补偿方案不公正：协议拆迁中，拆迁补偿是双方谈判的重点之一。如果拆迁方案的补偿方案不符合法律规定或不公正，政府可以对协议拆迁的房子进行征收。例如，某城市协议拆迁时，房屋所有者拒绝接受政府提供的拆迁补偿方案，认为方案不公正。政府可以通过强制征收的方式，适当地提高拆迁补偿标准，从而保证房屋所有者的合法权益。
总之，虽然协议拆迁形式灵活、对房屋所有者权益保护较好，但在一定的法律规定下，政府仍然有权对协议拆迁的房子进行征收。
