公司如果怀疑员工挪用公款，通常会通过以下方式确认:
1. 对账。企业应该每月对账，对公司账目进行核对。如果公司账目的数字与银行账目数字存在差异，可能会是挪用公款的迹象。
2. 财务稽核。公司的财务部门可以对账目进行稽核，检查财务记录是否准确。财务稽核可以检查每个员工的个人账目，包括报销、借款等。
3. 审计公司。公司还可以聘请外部审计公司来对账目进行审计。审计公司可以检查公司的账目和发现挪用公款的迹象。
4. 查看支票记录。公司可以查看支票记录，以确定是否有大量的支票被写成现金，并或是被用在不应该被用的项目上。
5. 调查员工。如果公司怀疑某个员工挪用公款，可以要求该员工解释账目中的异常情况。如果员工无法解释这些异常情况，则可能会被认为是挪用公款的迹象。
6. 监控银行账户。企业可以通过监视银行账户，以确保员工不会未经授权地将公司资金转移到其他账户。
总之，如果公司怀疑员工挪用公款，必须进行调查。公司可以使用上述方法来确定是否存在挪用公款的情况，如果发现有员工挪用公款的迹象，则必须采取相应的行动，确保公司的资产得到保护。
