农村宅基地的处理需要涉及到多个部门，具体由哪些部门处理取决于不同的情况。
首先，如果农村宅基地的流转涉及到土地使用权的转让或变更，那么需要由农村土地管理部门进行处理。这个部门负责农村土地的管理和出让，并且有权审批涉及土地使用权的变更、转让等手续。
其次，如果农村宅基地需要进行规划、设计、建设及验收，那么需要由县级以上的住建部门进行处理。这个部门负责城乡建设的规划、管理，并且有权进行工程的验收和相关手续的审批。
同时，农村宅基地的流转还可能需要涉及到农村集体经济组织的公共事务管理，这时需要由农村集体经济组织的管理部门进行处理。这个部门负责农村自然村、村民小组、集体经济组织的组建、管理和公共事务的协调解决等。
最后，如果农村宅基地的流转涉及到财务和税务等问题，那么需要由当地的税务和财政部门等相关机构进行处理。这个部门负责税收、政府财政预算、资产管理以及财政资金等管理事宜。
总之，农村宅基地的处理需要协调多个部门的工作，需要办理的手续也相对较多。不同区域、不同流转情况可能需要牵涉到不同部门的处理，因此，在处理时应该根据自己的情况和需要，合理地选择相应的部门进行处理，以避免不必要的麻烦。
