衢州离婚协议可以在以下机构进行办理：婚姻登记处、公证处、人民调解委员会、律师事务所等。其中，推荐找专业律师事务所进行离婚协议的起草和审核，其具有法律专业知识和实践经验，可以更好地保障离婚双方的合法权益。
具体办理流程如下：
1. 双方达成离婚协议，或由一方起草离婚协议，并经对方确认签字。
2. 准备好本人及对方身份证明、结婚证等相关证明材料。
3. 前往婚姻登记处、公证处、人民调解委员会等机构提交申报材料。
4. 机构进行审核后，公证并签署离婚协议。如果有财产分割，则需要前往当地房产、车管所等相关部门进行登记。
需要注意的是，离婚协议应当依法保障双方合法权益，包括有关抚养子女、财产分割、赡养、债务等问题。离婚协议一经签署，即具有法律效力，双方必须遵守协议内容。
总之，无论在哪个机构办理离婚协议，双方都应尊重对方，诚信签署协议，避免冲突和伤害。同时，对于离婚协议的起草和审核，建议找专业律师协助，以确保离婚协议合法、公平、合理。
