山东农村宅基地确权可以在当地政府部门进行查询，如乡镇政府、村委会以及土地管理部门等。具体查询流程如下：
1.准备相关材料。需要准备的材料包括证明房屋及土地的权属关系的合法证件（土地证、房产证等）、申请人的身份证明（身份证、户口簿等）以及其他可能需要的证明材料。
2.填写申请表。可以从当地政府部门获得申请表格，填写个人基本信息，附上所有申请材料并签字盖章。
3.提交申请表。将填好的申请表和相关材料一并提交到当地政府部门。
4.等待审核。政府部门会对提交的申请表和材料进行审核，审核通过后会进行现场勘察和登记。
5.领取宅基地证。审核通过后，政府部门会出具宅基地证，颁发给申请人。申请人可以携带相关证明材料到土地房产交易中心接受宅基地证的登记办理。
需要注意的是，宅基地确权需要具备一定的法律条文基础和行政流程基础，申请时需要仔细阅读相关法规和政策，遵守当地相关规定和程序，确保申请成功。
