如果签署了协议结婚并且约定了不生育，但在婚姻中仍然无法避免不孕的情况出现，这样的婚姻面临着很大的挑战。由于双方早已知晓不孕的情况，因此可以尝试寻找其他的解决方式，例如领养等。然而，如果在无法解决的情况下，双方仍然不愿意继续维持这样的婚姻，那么离婚则是不可避免的。
离婚涉及到大量的法律程序和性质，可以咨询专业的律师或法律机构来获取帮助。然而，在离婚流程中，有一些关键点需要双方注意：
首先，任何合同协议都不能违反法律规定，例如规定不能生育的合同是违法的。因此，协议结婚并不意味着可以忽略婚姻法律的约束力。
其次，对于协议离婚，双方需要在法庭上达成和解或离婚协议，这可能会导致一些争议。尽管在婚前签署的协议可能被视为证据，但它并不能过度影响法庭判决。
此外，双方需要充分了解离婚后的财产分配与抚养费用等问题，以避免争议。如果协议结婚中涉及到相关财产的分配和经济赡养的问题，需要在婚姻中各自履行的义务中进行约定，保障双方的合法权益。
总之，协议结婚不孕的情况下，如果双方无法和解解决问题，离婚是不可避免的，需要通过法律途径来维护双方的合法权益。在协议离婚的过程中，需要注意法律的规定，慎重考虑涉及的问题，以免对自己造成不利影响。
