是的，法院判决的协议离婚是一种合法的离婚方式。在离婚的过程中，当夫妻双方不能协商或者协商无果时，可以选择向法院提出离婚诉讼。法院会依照相关法律进行审理，并根据双方的协议或者判决作出最终的裁决。
对于协议离婚，法院会要求双方在离婚协议书中明确约定离婚后的财产分配、子女抚养权、探视权、赡养责任等事项，并签署协议书。法院会审核协议是否符合法律规定和双方真实意愿，确认后判决离婚，并依照协议书的约定决定离婚后的财产分配和子女抚养等事宜。
与传统离婚方式相比，协议离婚具有以下优点：首先，可以缩短离婚的时间和费用，节省双方的精力和金钱；其次，可以缓解离婚纠纷，降低离婚的矛盾和对立；最后，可以保护双方的合法权益，达到双赢的效果。
总之，协议离婚是一种全面合法的离婚方式，双方应该充分了解相关法律规定和自身权益，依法合理协商，争取达成一份公正合理的协议离婚协议。
