可以跨市协议离婚。根据我国《婚姻法》规定，夫妻一方或双方都可以向当地人民法院提出离婚申请。因此，夫妻双方如果分别在不同的城市工作或居住，也可以协商离婚并达成协议，然后向各自所在的法院提出离婚申请。
具体来说，双方可以通过电话、邮件等方式进行协商，并签署离婚协议书。协议书要明确双方的离婚意愿、离婚协议的具体内容，如子女抚养、财产分割等，以及离婚后各自的权利和义务。若协议书没有争议，各自提出离婚申请即可，法院也会予以支持。
不过需要注意的是，离婚协议需要获得法院的认可，才能生效。离婚协议书应该由律师起草，符合法律规定。离婚后财产的分割和子女抚养等问题要得到双方当事人的协商一致，同时也要符合法律规定。如财产分割，要按照法定继承顺序或夫妻协议的约定进行；子女抚养问题，则要考虑子女的利益，做到公平合理。
总之，可以跨市协议离婚，但需要注意协议书的合法性和法律规定的遵守，以确保离婚顺利完成。
