尊敬的相关各方：
经过沟通协商，在彼此的共同愿意下，就（村名）村（名字）用地出现的宅基地纠纷，达成以下共识：
一、纠纷原因
1.买卖瑕疵，房屋所有权出现争议。
2.建房违规，造成村民的利益受到侵害。
二、协议内容
1.对于陈某村民的房屋所有权产生争议问题，该村民同意放弃房产所有权，其所占用的土地交还村委会，经过协商后，该土地用途被规定为公共设施用地。
2.对于方某村民所建房屋违规问题，方某村民同意拆除该房屋，所占用的土地归村委会所有。如村民需要在该土地上重建房屋，需要重新申请宅基地使用权。村委会将进行严格审查，保证符合相关法律法规要求。
三、双方责任
1.村民在改变宅基地使用性质时必须获得村委会同意，并在政策允许范围内使用土地；
2.村委会要加强对土地使用的监管，确保村内宅基地的合规使用。
四、纠纷的解决方法
1.双方应当加强对宅基地使用证的保存和管理，防止出现因记录不清造成的争议。
2.对于宅基地纠纷的发生，双方应当主动协商解决，避免长时间引发不必要的争执，并在遇到解决难题时寻求相关法律咨询和帮助。
五、协议生效与变更
1.本协议自双方签字之日起生效，并严格按照内容执行。
2.如有协议内容需要更改，必须经过双方同意并签字盖章后方可变更。
六、签字
该协议自经过双方签字盖章后生效。
村委会代表：___________（签字）；
村民代表：___________（签字）。
以上就是针对农村宅基地纠纷协议的模板，注意事项及签字的方式等具体内容仍需要按照实际情况进行进一步制定。
