拆迁补偿协议是指在城市更新、改造、重建等项目中，政府部门与居民、企事业单位等签署的一份协议，协议内容涉及拆迁补偿及补偿方式、补偿标准、补偿期限等方面的内容。拆迁补偿协议的存放问题，是一个比较严肃和重要的问题。
根据我国有关法律和规定，拆迁补偿协议的存放主要涉及到以下部门：
1. 土地管理部门：土地管理部门是指国土资源行政主管部门，该部门是颁发拆迁补偿协议的主管部门。所以，拆迁补偿协议首先应该存放在土地管理部门内部或者该部门办公室的档案室里。
2. 房屋管理部门：在拆迁补偿协议中，一般会涉及到房屋的拆迁以及补偿问题，所以该协议也应该在房屋管理部门进行存放，例如住建委等部门。在住建委等房屋管理部门中，应该有专门的存放协议的档案室。
3. 公证处：在拆迁补偿过程中，为了确保居民和政府之间的权益，往往需要进行公证。公证处会对经过公证的拆迁补偿协议进行归档存储，具体存储方式可以根据不同的地区而有所不同。
总之，拆迁补偿协议的存放问题需要参照不同的政策法规和规定，需要归属于多个部门，每个部门都必须严格按照备案流程进行管理、存放和查找。只有这样才能有效保护人民群众的利益，保障社会的公平和公正。
