协议离婚可以改变夫妻双方的户口本，但需要遵循相关程序和规定。
首先，在协议离婚后，需要前往户籍所在地的派出所或乡镇政府申请办理变更户籍手续。申请人需携带本人的身份证、户口本以及离婚协议书等相关材料，同时需要提供离婚协议书上的配偶签字或公证书等证明配偶已确认协议内容。
其次，变更户籍需要符合一定的规定，比如变更前的户籍本应当被注销，同时需要提供符合要求的新的户籍登记表等，以便完成户籍的变更手续。一般来说，离婚后的户口变更需要在一个月内完成。
最后，需要注意的是，户口变更也会对其它社会保障等方面产生影响，需要与其他部门的相关政策进行协调，确保户口变更后的各项权益得到保障。
总的来说，协议离婚可以改变夫妻双方的户口本，但需要注意办理的规定和流程，以免出现查询不到户籍信息的情况。
