重庆离婚协议可以在以下机构办理：
1.民政局：民政局是最常见的离婚协议办理机构，可以办理夫妻双方自愿离婚协议的登记。在此办理的优点是手续简单、便捷，办理速度快。
2.法院：如果夫妻双方不同意离婚或者双方财产分割等问题无法协商一致，可以向法院申请离婚，并由法院审理解决。
3.律师事务所：由专业的律师代理处理离婚协议，可以减少夫妻之间的矛盾和纷争。律师事务所可以根据个人情况进行专业化的法律咨询和协助处理离婚协议。
无论在哪里办理离婚协议，都需要双方夫妻共同前来，并填写离婚协议书。在填写协议书时，需要明确规定离婚后的财产分割等重要事项，以便日后不会产生纠纷。
总之，离婚是一件伤害很大的事情，如果夫妻双方能够通过协商一致达成离婚协议，则可以减少对夫妻之间的矛盾和伤害。如若遇到纠纷，可以向专业的机构或者律师求助。
