自从全国宅基地政策出台以来，农村宅基地的数量和质量都得到了很大的提升，但是在实际操作中，宅基地变更仍然存在很多问题。这些问题主要包括：手续复杂，审批周期长，需要支付高昂的费用，且很难被批准。
首先，手续复杂是农村宅基地变更的主要问题之一。宅基地变更需要填写很多文件和资料，包括证明书、调查报告、规划方案和审批意见等等，而且这些文件和资料要求十分严格，一旦有一项缺失或者填写不准确，就会导致延误或者申请被拒绝。这使得农民申请宅基地变更的工作变得非常繁琐和复杂。
其次，长审批周期也是农村宅基地变更的难点。在市县政府、规划局、国土资源局、建设委员会等部门的审批周期中，时间长达数月，有的甚至需要半年左右的时间。这不仅会影响农民家庭的正常生活，也会耗费大量的时间和精力。
第三，高昂的费用也是农村宅基地变更的难点之一。按照现行规定，宅基地变更必须支付高昂的费用，包括土地使用税、建设用地出让金和审批费等，这使得很多农民承受不起这些费用，只能放弃申请宅基地变更。
最后，很难获得批准也是农村宅基地变更的难点之一。由于宅基地的土地审批流程非常复杂，很多农民即便完全符合变更条件，也很难获得宅基地变更的批准。
总的来说，农村宅基地变更手续复杂、审批周期长、费用高昂、难以获得批准等问题，需要政府在相关政策制定中加以考虑，从而为农民提供更好的服务和便利。
