协议离婚档案包括以下内容：
1. 离婚协议书：离婚协议书是协议离婚的主要文件，协议离婚必须签署离婚协议书。离婚协议书应当包括双方离婚意愿、子女抚养、财产分配等事项的约定。
2. 离婚登记申请书：离婚申请书是协议离婚的必要申请文件，双方应当在离婚申请书上签字并提供相应的证明材料。
3. 房产证、车辆行驶证等财产证件：财产证件是协议离婚必须准备的重要文件，这些文件是财产分配的基础。
4. 出生证明、户口本等子女相关证件：协议离婚涉及子女抚养问题，需要提供相关证明材料。
5. 离婚调解书：协议离婚经过民政部门的调解，应当有相应的调解书。
6. 律师代理委托书：离婚过程中，律师代理是必要的，需要双方签署委托书。
综上所述，协议离婚档案的内容较为繁琐，需要涵盖双方离婚意愿、子女抚养、财产分配、证明材料以及律师代理等方面，而相关文件的准备也需要引起双方的高度重视。
