如果配偶失踪，孩子的抚养权将会由法院判决。在判决过程中，法院将会考虑以下几个因素：
1. 孩子的利益：法院将优先考虑孩子的利益，确保他们的生活和教育得到妥善安排。
2. 抚养能力：法院也会考虑父母的抚养能力，包括他们能够提供的物质和精神支持。
3. 父母的行为表现：如果父母中有一方失踪，法院也会考虑这一方之前对孩子的关爱表现以及其他对孩子的行为表现，以确定他们是否有足够的能力照顾孩子。
在确定孩子的抚养权时，法院也会考虑孩子的意愿，特别是在孩子已经成年或足够成熟的时候。如果孩子能够表达自己的意愿，并且这一意愿被视为符合他们的利益，那么法院通常会考虑他们的意愿来做出判决。
总之，在确定孩子的抚养权时，法院将综合考虑一系列因素，确保孩子得到妥善的安置和抚养。如果你是一名单亲家庭的父母，在非常时期里一定要尽力去为孩子的未来做出最好的选择。
