拆迁协议可以部分抵门面契税，但具体情况还需要根据当地税收政策和拆迁协议的具体内容来确定。
首先，我们需要了解门面契税是什么。门面契税是指商业用地的买卖、租赁等行为所涉及的一种税收，是根据地方税种规定收取的。依据《中华人民共和国城市房地产管理法》第八条规定，门面契税的纳税义务人包括购买、接受赠与、人口平均收入登记年度评比、承租、变更房产权属等。
拆迁协议包括了对房屋拆迁后的经济补偿、居住补偿等内容，因此实际上就是一种房屋买卖的形式，所以它确实可以在一定程度上抵门面契税。但是，拆迁协议能够抵扣的门面契税金额的上限和具体情况会根据国家和当地的税收法规和政策而有所不同。
总的来说，如果您的拆迁协议中确实包括了商业用途的补偿费用，那么您可以在纳税时向税务机关申请抵扣门面契税。不过，具体金额和比例还需要因地制宜地进行核算，最好咨询当地的拆迁和税务部门，获得更为准确的答案。同时还需要注意，门面契税与拆迁协议的相关规定可能会随着时代的变化、政策的更新而有所变更，所以在进行相关交易时，还需留意相关政策和法规的更新情况，以避免因此而导致的纳税压力或其他问题。
