合同里有协议的离婚，首先需要注意的是，协议只是离婚过程中的一种协商方式，但并非是法律判决的替代品。因此，在离婚过程中，双方需要遵守法律规定，以法律的形式进行离婚。
在具体的操作过程中，可以先以协议的形式商定双方的财产分配、子女抚养、财产债务以及其他相关事项等，在这里需要引起双方共同的协议，且文件需要双方的签字和公证的认证等程序，便于在离婚过程中起到一定的法律作用。同时，如果在协议过程中出现了争议，可以尝试寻求调解或者通过法律起诉的方式解决。
其次，在协议的基础上，需要进行正式的离婚手续。在此过程中，需要前往当地的民政局办理离婚手续，包括填写相关表格、提供必要的材料证明以及支付离婚手续费用等，最终签署离婚证书。
总体而言，协议只是离婚过程中的一个重要环节，但并不能替代离婚的法律手续。因此，双方需要在协议的基础上，遵守法律规定，进行正式的离婚手续，才能确保离婚效力的合法性和权益的保障。
