如果离婚双方在签署离婚协议时只有一份协议，需要采取以下措施来确保协议的有效性和完整性：
1. 尽快制作复印件。签署离婚协议后，尽快制作协议的复印件以备不时之需。如果可能，最好将复印件保存在双方都能接触到的地方，以避免协议的遗失或破损。
2. 寻找证人。尽可能找到一些证人，在签署协议时观察整个过程，并确认这是离婚双方真实的意见和签署协议的行为。证人的证言可以增强协议的有效性和完整性。
3. 向法院申请办理离婚。如果离婚协议只有一份，离婚双方可以向法院申请办理离婚。离婚程序通常需要一些时间，并需要完成一些必要的程序，如财产分割和子女抚养安排等。
4. 寻求专业人士的帮助。在申请离婚前，离婚双方可以寻求婚姻家庭咨询师或律师的帮助。这些专业人士可以协助离婚双方制定合理的离婚协议，并指导双方在签署协议时避免一些常见的错误。
总之，离婚协议只有一份可能会带来一些后续问题。离婚双方可以采取上述措施来降低风险，并确保离婚协议的有效性和完整性。
