离婚协议是一种法律文件，包括离婚双方的财产分割、子女抚养权、探望权等内容。离婚协议必须满足法定要求，离婚双方在离婚协议上所达成的协议具有法律效力。离婚协议当中，往往会包含分居协议这一条款。
分居和离婚不同，是指夫妻生活在不同房屋内，身体上不再共同生活，但是法律上仍然是夫妻关系，没有解除婚姻关系。分居可以在离婚协议当中协商规定，因为在有些情况下分居可能是双方的共同意愿。例如，夫妻关系出现问题，但是双方不想离婚，只是想暂时分居一段时间以缓解紧张的情况。在这种情况下，分居协议可以解决双方分居期间的财产分割、子女抚养问题等。
然而，分居并不能代替离婚。在离婚协议当中规定离婚和分居的区别非常明确，分居只是暂时的措施，而离婚是对婚姻关系的彻底解除。如果夫妻在分居期间，他们的关系没有改善，分居时间过长且没有调解的余地，就可能会面临离婚的现实。
综上所述，离婚协议可以包含分居协议，但是分居协议并不能代替离婚协议，只是暂时的措施。离婚协议是一份重要的法律文件，准确无误的起草离婚协议将有助于双方避免因此而产生的矛盾和纠纷。因此，当夫妻关系出现矛盾时，可以选择在分居协议中协商规定，或者在涉及离婚的情况下征求专业法律意见，以便自己的合法权益得到有效的保障。
