分居两年的夫妻如果存在孩子抚养问题，一般可分为以下几种情况：
1. 双方已达成协议，孩子抚养权已明确划分。这种情况下，双方可以按照协议履行义务。
2. 双方无法协商达成一致，需要通过法律途径解决。在这种情况下，需要到法院起诉离婚，并在离婚诉讼中申请孩子抚养权。在法院审理阶段，双方可以提供相关证据，例如状态良好的监护人，孩子的学校成绩等，以争取孩子的抚养权。
3. 双方没有正式离婚，但已经分居了两年。在这种情况下，任何一方都有权向法院提起离婚诉讼，并申请孩子抚养权。因为已经分居两年，孩子的抚养权问题比较复杂，需要根据具体情况进行判决。
无论是什么情况，孩子的抚养权都是非常敏感和重要的问题，需要双方多进行沟通和协商，并尽量不影响孩子的成长和生活。如果无法解决纠纷，可以寻求法律援助，尽可能通过合法途径解决问题。
