分居两年后，如何复合并达成离婚协议是一个相对复杂的问题。首先，复合需要根据双方的意愿和情况来决定。如果两人都认为可以解决问题并继续婚姻，则可以考虑复合。如果双方都同意复合，那么需要制定一个详细的计划，包括重建婚姻的方式、如何处理过去的问题、如何改善沟通等方面。
在协议中，应该包括离婚的具体条款，如财产分配、子女抚养和探视、抚养费和配偶赡养等。离婚协议中要涉及到的内容非常丰富，需要双方充分协商，明确协议的有关规定，以保障双方的合法权益。
此外，一旦达成协议后，双方还要向律师提交协议并签署合法有效的文件，以确保协议的实施可行。离婚协议一旦签署，即成为双方之间的法律文件，双方都必须遵守其中的条款。
总而言之，在分居两年后复合并达成离婚协议并不是一项简单的任务。需要雄厚的谈判技巧和法律知识，以确保协议的可行性和合法性。同时，双方也需要保持良好的沟通和合作，共同达成协议，形成长期的和谐婚姻关系。
