离婚协议是夫妻离婚的法律文件，其中也包括了夫妻共同财产和债务的分配方案。如果离婚协议中规定了公司的抵押问题，那么离婚后的夫妻应该按照约定进行处理。
如果公司已经抵押，那么首先需要考虑的是如何处理债务。如果夫妻共同还有公司的债务，那么应该尽快偿还，避免拖长时间导致利息的逐渐累加。如果不能偿还全部债务，可以与债权人协商分期偿还或者延长还款期限。
如果另外一方同意放弃对公司的所有权，也可以考虑将公司出售或者转让给第三方，以清偿债务或者将资产分配给夫妻双方。如果不能达成一致，也可以通过法律途径解决，例如申请强制执行或者在法院之间进行解决。
总之，在公司已经抵押的情况下，离婚协议的内容应该具体分析，根据情况进行处理，既要考虑资产分配，也要考虑债务清偿。夫妻双方最好在离婚协议中就公司抵押问题作出明确约定，以避免后续的纠纷。
