批准农村宅基地的部门主要是农村土地管理部门。在中国，农村土地管理部门是指县级及以上的土地管理部门，也可以称为乡镇财政局。这些部门在批准农村宅基地时需要依据相关法律法规，以及宅基地征收、使用管理办法等文件的规定，审批各地的宅基地申请。
具体来说，农村宅基地的批准程序如下：
首先，申请人需要先向乡镇政府和农村土地管理部门提出申请，并提供相关的资料和证明文件。这些文件一般包括宅基地的土地权属证明、土地调查报告、规划设计方案、用途说明、建设预算和承诺等。
其次，乡镇政府和农村土地管理部门会对申请人提交的资料进行审核，确保申请人符合宅基地使用的条件、建设规模和用途等要求。审核合格后，可以出具批准意见，将申请人的宅基地申请报送县级土地管理部门审批。
最后，县级土地管理部门会对宅基地申请进行审批，并依据有关法律法规和规定，做出是否批准宅基地申请的决定。如果决定批准，则可以颁发宅基地证和土地使用权证，将土地的使用权转让给申请人。
需要指出的是，在批准农村宅基地时要注意一些问题。比如，不能超出农户的合法用地范围、不能影响生态环境、不能影响农业生产等。同时，还应加强监管，防止违规行为的发生，确保宅基地的合法性和安全性。
