拆迁协议书签名时，使用任何颜色的笔或者签字笔都是可以的。因为签名本身的意义是表明签字人的身份、同意书面内容并承担相应的法律责任。颜色并不影响签名的法律效果。
不过，如果是在拆迁协议书中并不建议使用过于鲜艳的颜色，例如红色、橙色等。因为这些颜色过于醒目，容易引起注意，可能被认为是在强调某些内容，可能会引发不必要的纠纷。
一般来说，黑色、蓝色、灰色都是比较常用的签名颜色。如果签名人数较多，为了避免混淆，建议每个人使用不同的颜色签名。
此外，无论使用哪种颜色，签名前都应该认真阅读协议的全部内容，确认自己已经充分理解并且愿意承担相应的责任，然后再进行签名。签名是一个法律行为，应该尊重协议的约定，并且信守承诺。
总之，拆迁协议书签名不需要过于注重颜色，关键是认真阅读、理解并遵守协议的内容。
