首先，如果您想申请低保分别后，必须要先提交离婚协议。离婚协议是夫妻双方就离婚事项达成一致意见的书面文件，其中必须明确财产分割、子女抚养等有关事宜。根据国家法律规定，离婚协议双方必须面对面签订，由双方代表律师办理离婚手续。
申请低保的话，需要先到户籍所在地的社区居委会、镇政府或区、县民政局的救助管理科进行申请，提交相关材料。需要准备的材料包括：身份证、户口簿、结婚证、离婚证或离婚协议、收入证明或困难证明等。
同时，需要注意的是，离婚协议的申请和办理离婚手续都需要按照国家相关法规和程序进行。在签订离婚协议时，应该注意合理公正的财产分割和保障子女的合法权益，在办理离婚手续时，应该严格遵循法律程序，确保不违反国家相关法规。
总之，申请低保离婚协议是一个比较复杂的过程，需要注意许多细节和法律程序。如果您有相关的需要或疑问，可以咨询相关的法律专家或社区工作者，获取更全面的帮助和指导。
