婚后分居协议是指夫妻双方在婚姻关系存续期间，因某些原因而协商决定不在同一居所居住，但不解除婚姻关系的一种协议。婚后分居协议可用于减少夫妻间的矛盾和争执，以及维护子女的权益。但若由于分居方的原因或分居协议的约定导致对方遭受压力或不公平对待，婚姻关系依然有可能破裂，需要离婚来解决。
婚后分居协议离婚的时间取决于协议中的具体约定。一般情况下，离婚协议需要经过法律程序并获得法律认证才能生效。如果双方达成的分居协议中约定了分居期限或离婚条件，在符合条件或期限后，双方可申请办理离婚手续。在中国，离婚协议需经过当地公证处公证，获得公证书后方可生效。一般情况下，离婚协议的公证时间需要在一个月左右。
需要注意的是，如果夫妻暂时分居后没有签订婚后分居协议，只是亲自达成口头协议，这时离婚手续可能会比较复杂。因为双方要在离婚协议上达成同意，才能进一步申请离婚。如果一方不同意离婚，离婚协议就无法达成。但是，在实际操作中，如果双方达成口头协议，也可以通过法院的调解达成离婚协议。
总之，婚后分居协议离婚多久生效取决于协议中的约定以及当地法律程序的要求。离婚协议的签订和公证是重要的保障措施，可避免离婚造成的财产分割和抚养权纠纷等问题。无论是在分居协议还是离婚协议中，双方一定要在协商过程中保持理性和冷静，做出对自己和子女最有利的决定。
