农村宅基地房登记注册公司是有多重限制的，需要遵守法律法规，并经过多个部门的审批和批准。首先，根据《中华人民共和国宅基地法》和农村土地管理法，《宅基地使用权证书》上注明“限定该土地用于个人居住和生产经营”，即宅基地房屋不能作为商业、工业、办公等公共用途，因此也不能作为公司注册地址。
其次，宅基地使用权是集体土地经营权，不能通过出租、转让等形式变更其性质，也不能进行股份制改造等，否则将违反宅基地法规，并受到相关法律的制裁。
最后，如果宅基地房屋作为公司注册地址，将会在税务、工商等多个环节遇到法律问题，也容易引发社会不稳定因素，因此不建议在农村宅基地房屋上注册公司。
综上所述，在农村宅基地房屋上注册公司是不合法的，也是不可取的。同时，我们应该尊重法律，遵守宅基地法规，避免违反相关法律法规所造成的不良后果。
