是的，当然可以。无论是男兵还是女兵，都可以通过协议离婚的方式结束婚姻关系。事实上，军人的婚姻离婚和非军人没有什么区别，法律上没有针对军人的特殊规定或限制。
但是，由于部队的特殊性质，军人的离婚可能会涉及到一些特殊问题，比如抚养权问题。如果双方离婚后都要继续服役，那么就需要考虑孩子的抚养问题。在这种情况下，双方需要协商达成一份合理的协议，确保孩子的生活不受影响。
此外，由于军人可能经常调动，对于分割夫妻共同财产的问题也需要特别处理。例如，军人可以选择将房产和其他财产留给子女或其他家庭成员，以免频繁搬家带来不必要的麻烦。
总之，军人协议离婚和非军人没有太大的区别，但需要特别注意抚养权和财产分割等问题。尤其是需要确保孩子的权益得到保障，以及尽可能减少离婚带来的影响，保障双方的合法权益。
