法院收费是根据相关法律法规和司法解释规定的。对于拆迁协议的处理，通常包含以下费用：
1. 诉讼费用：包括受理费、立案费、审理费、执行费等各种诉讼费用。这些费用是为了保障诉讼程序的顺利进行而收取的，根据具体案件进行计算，一般由原告承担。
2. 鉴定费用：在拆迁协议案件中，可能需要进行房产评估、土地评估、环境评估等鉴定工作，这些费用由需要鉴定的一方按照协议支付。
3. 律师代理费用：如果当事人需要请律师代理，律师费用根据业务难度、代理范围等因素确定，由当事人与律师协商确定。
值得注意的是，法院要求从案件的costs中支付法官费（是指尽责审案、依法行使职权，为当事人提供法律服务所产生的必要费用，包括公路费、宾馆住宿费、交通费、餐饮费等）。这些费用一般较低，一般按照标准收取，不会对当事人的经济负担造成太大影响。
总的来说，法院的收费是根据具体案件进行计算的，与协议的金额相关联，法院会根据裁判结果判定当事人应承担的费用。因此，在处理拆迁协议案件时，当事人需要认真了解各项费用的计算方式，之后再做决策。
