协议离婚后补偿费用的计算方法根据不同的情况而异，一般可以从以下几个方面考虑：
1. 婚前财产和个人财产：如果双方在婚前就拥有了一定的财产或个人财产，协议离婚时应该将这些财产进行分配。一般来说，在婚姻期间获得的财产应该平分，而婚前财产或个人财产则归各自所有。
2. 赡养费用：离婚后，如果有儿女，则需要计算赡养费用。根据《中华人民共和国婚姻法》规定，父母应当共同承担子女的抚养费用。具体的费用多少需要视家庭实际情况和双方能力而定。
3. 暂时性抚养费：如果离婚后，儿女仍有未成年人，双方需要协商，由未成年子女居住一方承担暂时性的抚养费用。
4. 物业分割问题：如果有物业需要分割，需要按照物业的公允市场价值进行分配。
5. 离婚补偿费：如果离婚是因为某一方的原因造成的，另一方有可能会获得离婚补偿费。离婚补偿费多少需要根据具体情况来确定，一般应由双方协商确定。
总之，在离婚协议中，需要考虑到很多因素，包括财产、抚养儿女、物业和离婚补偿等问题，这些都需要根据实际情况进行协商并达成一致。
