在协议离婚中，如果男方借了钱但尚未归还，需要进行清算。以下是几种可能的解决方案：
1. 让男方在离婚协议中承担清还借款的责任。这种方式可以让双方在离婚协议中明确规定清偿借款的责任，可能会需要另外的法律文书，比如一份还款协议。
2. 按双方共同协商的方式清还借款。如果离婚协议中没有明确规定男方清还借款的责任，可以通过协商的方式解决。双方可以根据实际情况，商量借款如何清偿，包括清偿的时间、方式、利息等。这种方式需要确保协商是公平、合理的，以避免一方受到不公正待遇。
3. 要求男方在财产清算中扣除相应款项。如果男方在财产上有足够的财产可以清偿借款，另一方可以要求男方在财产分割时直接扣除相应的借款，以避免双方在财产分割后还需要繁琐的还款操作。
需要注意的是，离婚带来的财务纠纷存在很多复杂因素，建议双方在协商解决方式前，咨询专业律师指导，以确保协商的合法性和公正性。
