农村宅基地档案存放的地方其实是有规定的。首先，根据《农村集体土地建设用地管理办法》规定，宅基地使用者可以向村委会或者乡（镇）政府申请领取《农村宅基地使用权证》和宅基地图件。这两份材料就是宅基地档案的主要内容。
其次，这些档案还需要依据《土地管理法》的规定进行保存。按照法律规定，宅基地使用权证须由宅基地使用者或其继承人妥善保存，并在移交、受让或者抵质押、转让宅基地时，应当随同移交、受让或者抵质押、转让的土地证明一并出示。而宅基地图件则需要交由村委会或乡（镇）政府妥善保管，由具备承担宅基地管理职责的组织进行存储、管理、更新，并建立相应制度，确保其可追溯性和完整性。
此外，由于宅基地使用权证和宅基地图件都是重要的土地产权证明，因此也需要备份一份存放在县级以上土地管理部门备查。
总之，农村宅基地档案的存放应当遵循法律规定，宅基地使用者需妥善保管宅基地使用权证，乡村组织要妥善保管宅基地图件，并做好更新管理工作，县级以上土地管理部门也需要备份一份，以确保相应的土地产权证明能够被顺利使用和追溯。
