南京拆迁安置房归属的部门比较复杂，需要多个部门协调合作来完成。一般来说，包括国土资源局、城市建设部门、住房和城乡建设部门以及民政局等多个部门都会参与拆迁安置房的管理和维护。
具体来说，国土资源局主要负责土地资源的管理、分配和使用，包括拆迁安置房项目的用地申请和审批工作。城市建设部门则负责规划和建设拆迁安置房，包括确定拆迁安置的位置、设计规划、建设和验收等各环节。住房和城乡建设部门负责拆迁安置房的质量、安全和维护，对拆迁安置房进行验收和检测，并对房屋的质量监管。民政局则负责拆迁安置的政策制定、补偿标准的制定、协调拆迁补偿和安置等工作。
在具体的工作实践中，南京拆迁安置房归哪个部门管的问题并不是非常重要，因为各部门之间需要协作配合，才能顺利完成拆迁安置房的建设和使用。只有在各部门之间建立起高效协作的机制，才能确保拆迁安置房的建设和管理得到充分保障，以满足居民基本的住房需求和权益。同时，政府需要考虑住房的供给与需求，切实解决住房问题，为城市居民提供更好的生活品质。
