农村拆迁政府协议书在一定程度上是有效的。但是其法律效力仍需评估协议内容、程序是否符合法律规定。具体来说：
首先，农村拆迁政府协议书是一种民事法律文件，可以表明当事人之间的意向和协议。只有在民事法律上对协议达成共识而意见一致时，才能达到协商双方满意的效果。因此，如果协议的内容和程序符合当地法律规范和法律程序，那么协议书是有效的。
但是也需要注意，政府和农村户主是不平等的交易。一些政府官员可能会利用他们在农村拆迁过程中的地位来压低农民的价格、无视农民的合法权益，从而导致协议书无效。此时，农民可以通过法律途径维护自身利益。
此外，在一些地方，政府协议书的拟定和签署可能存在不规范和非法的问题。政府这种单位不允许随意拟定、修改协议，有些时候由政府的自身利益追求其无视农村户主的意愿。如果协议书存在违法行为，那么协议书就是无效的。
总之，农村拆迁政府协议书有着一定的法律效力，但影响协议书效力的因素有很多，需要具体情况具体分析。不过，如果在任何情况下，协议书的内容和过程都符合法律规定，那么协议书就是有效的。
