协理员挪用公款是一种极为严重的违法行为，需要被严厉处理。一般来说，相关的处理程序应该如下：
首先，应该对协理员进行停职调查， 检查违规行为的准确性以及相关金额的数量等。在这种情况下，一定要确保所有违规行为都得到证实，以便进行下一步处理。
其次，应该考虑报案并向有关部门报告被盗所涉及的金额以及其他相关事项。应该严格遵守政策，并尽一切可能追回受影响的基金，以确保不影响项目的正常进行。
如果受影响的金额较小，我们可以选择给予警告、罚款或暂停合同等轻度惩罚。当然，这也要考虑到负责人的情况以及他们对项目的重要性，以此来制定最佳的惩罚方案。
如果涉及到的数量较大或金额包含重大财务损失，我们应该把协理员送交给执法机构进行调查和适当的惩罚。实际上，这些行为都是犯罪行为，需要得到法律的明确规定和制裁。
最后，无论协理员做了什么，我们都需要保持调查过程的透明度，并与相关人员进行良好的沟通。这就需要我们积极主动地向相关当事人解释这一遭遇及其结果，以避免信息不透明或产生错误解读。
总之，对于协理员挪用公款的行为，我们应该以最果断的方式进行处理，以维护项目的正常进行和公共的财务安全。
