村干部离婚协议在法律上是有效的。一般来说，夫妻双方可以达成协议，按照法律规定，通过调解或者裁决的方式解决婚姻问题，其中包括离婚协议。如果离婚双方在协议过程中遵循了法律规定，没有违反法律法规，那么该协议是符合法律规定的，也会被法律承认。
然而，在签订离婚协议时，夫妻双方需要注意以下几点。首先，离婚协议应当符合我国《婚姻法》的有关规定，离婚理由、抚养子女、分割共同财产等方面都应当依据法律。其次，离婚协议应当是双方自愿达成的协议，没有被强迫或者有其他违法行为。最后，离婚协议应当经过公证机关的公证，使其确权清晰、形式合法。
总之，村干部离婚协议在法律上是有效的。但是，在签订离婚协议时，夫妻双方应当依据法律规定和公正原则，达成合法有效的协议。如果双方在离婚过程中遇到问题，需要寻求律师的帮助，以便获得更好的法律保障。
