协议离婚的有效性不仅仅取决于是否有指纹，因为指纹只是用于验证文书真实性的一种方式。
协议离婚首先要确定离婚的意愿，双方要签署离婚协议书，协商好财产分割、子女抚养等事项，并提交相关证明文件。
如果双方提交的文件真实有效，离婚协议书经过公证或法院审理后生效，这才是协议离婚真正的有效性。
而指纹认证只是辅助验证文件真实性的一种方式，如现在的数字签名、电子印章等，都是用于证明文件真实性和完整性的方法。指纹是一种生物特征，可以证实签字者的身份，但不是必要的。同时指纹也并非绝对可靠，也存在被伪造的可能。
因此，在协议离婚中，指纹认证只是一种验证方式，但不是必要的标准。协议离婚的真正依据是离婚协议书以及提交的其他相关证明文件，只有这些文件真实有效，才能保证协议离婚的有效性。
