在网上申请法院离婚协议，首先要确定需要申请的管辖法院。根据当事人的居住地或婚姻登记地，可以选择合适的地方法院进行申请。然后，在该法院官网或司法局网站上查找相关的在线申请系统或表格。
填写申请表格时，需要提供自己的个人及婚姻情况，包括姓名、性别、年龄、居住地址、结婚时间、婚姻状况、是否有子女、子女情况等等。同时，也需提供离婚协议书，该文件应该明确离婚双方的财产、债务、子女抚养等事项，并由离婚双方签名确认。
提交申请后，需要等待法院审批，这一过程可能需要几天到几周不等。如果审查无误，法院会正式颁发离婚证书，并注销婚姻登记。
需要注意的是，网上申请法院离婚协议仅适用于双方协商一致、无争议并且申请人居住所在地法院有在线申请系统的情况。如果离婚存在争议，如财产分割、子女抚养、抚养费等方面的问题需要解决，需要进行司法诉讼，即通过律师向法院提起离婚诉讼。
