协议离婚后，如果双方对孩子的姓名有异议，需要对孩子的姓名进行变更，需要进行以下操作：
1. 协商：首先，父母应该协商孩子的姓名，双方应该达成共识。双方都应该考虑孩子的利益，因为孩子毕竟是无辜的。如果双方都同意，那么就不需要进一步采取行动。
2. 办理变名手续：如果父母不能达成共识，而父母中的一方希望对孩子的姓名进行变更，应该先委托律师起草变更姓名申请书，并对申请书进行签字和盖章。然后，将变更姓名申请书提交给当地公安局，办理户籍变更手续。在办理户籍变更手续时，需要提供相关证明材料，如协议离婚证书、出生证明、身份证等。
3. 通知学校、幼儿园等：一旦办理完户籍变更手续，应该尽快通知学校、幼儿园、医院等相关机构，告知孩子的姓名已经变更，以便机构更新相关记录。孩子的身份证等证件也需要重新办理。
总之，在协议离婚后，如果需要变更孩子的姓名，双方需要首先协商，如果不能达成共识，就需要委托律师起草变更姓名申请书，并前往公安局办理户籍变更手续。最后，应该尽快通知学校、幼儿园等相关机构，告知孩子的姓名已经变更。
