如果拆迁协议丢失了，应该及时联系当地有关部门，并提交相关的申请资料，进行补办。在补办拆迁协议的过程中，需要提供原拆迁协议及相关证明材料，以确保申请得到顺利通过。
如果无法找到原拆迁协议，申请人可以联系当地政府或拥有拆迁协议的相关单位，查找相关信息。如果需要进行证明，可以通过公证处或律师事务所提供相关证明材料。
在赔付方面，如果是因为拆迁协议丢失造成经济损失，申请人可以向有关部门提出赔偿申请。根据相关法律，对于因政府行为引起的合法财产损失，政府应承担相应责任并进行赔偿。因此，如果拆迁协议丢失造成了经济损失，申请人可以向当地政府提出赔偿申请，并提供必要的证明材料，以获得相应的赔偿。
总之，如果拆迁协议丢失了，申请人应该及时联系相关部门进行补办，并保留好相关证明材料，以便在需要时进行证明和赔偿。同时，也应该注意保护自己的合法权益，避免因拆迁协议丢失而造成的不必要的损失。
