北京协议离婚分区办理是指离婚双方在协商离婚协议时，根据分区分割财产的原则，对其共同财产进行分配。在此情况下，离婚双方必须明确各自的财产及共同财产，然后在协议书中注明财产分割的具体细节和条款。
在北京，离婚协议一般是由离婚双方自行协商并签署的，但要想让分区离婚协议生效，则需要进行司法认证。具体来说，离婚双方需要将协议书提交给所在地的人民法院，由法院进行审查、确认并颁发离婚证书。
需要注意的是，离婚协议的内容必须符合法律规定，不得违反法律纪律和公序良俗，否则协议将不具法律效力。此外，在分区离婚协议的过程中，对财产的估价、分割等方面可能存在纠纷，因此建议离婚双方在进行协商时要谨慎、详细地商议每一项条款，避免因协议条款不清晰而导致的纠纷和矛盾。
总之，在北京，分区离婚协议是可以办理的，但在办理过程中需要注意相关法律规定，并尽可能减少纠纷和矛盾。
